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El Biobanco vasco lidera el desarrollo de un buscador de muestras biológicas

JANO.es · 09 abril 2013

El proyecto Biopool permitirá que los científicos puedan buscar muestras en cualquier biobanco del mundo, a partir de la imagen histológica del tumor en cuestión.

Un consorcio comunitario liderado por el Biobanco Vasco para la Investigación ha puesto en marcha el proyecto Biopool, cuyo objetivo es desarrollar un buscador informático de muestras biológicas a partir de la imagen histológica y los datos clínicos asociados. Con ello se pretende facilitar a los investigadores el acceso a estas muestra.

Biopool permitiriá que los científicos puedan buscar en cualquier biobanco del mundo las muestras biológicas que necesita para su proyecto, independientemente del lugar e idioma, y a partir de la imagen histológica del tumor en cuestión.

Tal y como ha explicado Roberto Bilbao, director científico del Biobanco Vasco para la Investigación, “es una tecnología semejante a Google Imágenes, en la que incorporas una foto de un edificio al buscador, y el sistema te dice dónde está, pero aplicado a imágenes histológicas de tumores e investigación biomédica. De hecho, vamos a establecer una red inteligente internacional de biobancos, lo que demuestra el potencial de los datos clínicos e histológicos para la investigación médica”.

En la iniciativa participan diversas empresas y centros tecnológicos, entre los que figuran Tecnalia Research & Innovation, eMedica y Cultek, junto con otros socios internacionales que son Pertimm SAS (Francia), la Universidad de Brunel (Reino Unido) y el Biobanco Erasmus EMC (Países Bajos).

Por su parte, la investigadora Arantza Bereciartua, de Tecnalia, señala que el proyecto Biopool afronta un gran número de desafíos, tanto técnicos como no técnicos, “ya que debe ser capaz de manejar imágenes digitalizadas de diferente formato y de gran tamaño, llegando incluso a 10-15 GB por imagen. También hay problemas de escalabilidad y diferentes protocolos de adquisición de diferentes tipos de tejidos. Finalmente, la comparación entre diferentes imágenes es muy compleja debido a las diferentes escalas y formatos de imágenes, y la variabilidad biológica de muestras”.

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